集资建房协议书是购房合同吗

不是，属于单位集资房，是没有独立的房产证的，房管所部门不承认的，所以不可能有购房合同，未取得产权证的房屋是不能进行转让的，集资房也同样如此。买卖双方在未取得房产证之前的交易行为是不受法律保护的。
《民法典》第二百零八条 不动产物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。动产物权的设立和转让，应当依照法律规定交付。