主合同无效补充协议有效吗

主合同无效，那么原则上与之相关的补充协议，都是无效的。
因为补充协议，始终都只是主合同的延伸 ，是主合同的组成部分而已。根据《合同法》(自2021年1月1日起废止）第56条的规定，无效的合同，是自始无效的，那么理所当然的，相应的补充协议一般也就是无效的。
只有两种情况下，补充协议有效。
一种是无效合同终止后，双方重新达成的关于合同善后的协议是有效的。比如，因为购房资格的限制，导致购房合同无效；于是双方签订补充协议，终止合同；同时，卖方考虑到房价上涨、买房有利息等损失，愿意多补偿买方损失10万元。这样的补充协议，因为双方是对无效合同解除后，重新达成的损失结算协议，并不违反法律的规定，因此是有效的。
另一种是双方达成的关于纠纷解决的条款，根据《合同法》(自2021年1月1日起废止）第57条的规定，是有效的。比如律师费由过错方承担，双方在甲方所在法院诉讼解决，这样的条款不受合同效力的影响，是有效的。
法律依据：
《中华人民共和国合同法》第五十七条
合同无效、被撤销或者终止的，不影响合同中独立存在的有关解决争议方法的条款的效力。
《民法典》第五百零七条　合同不生效、无效、被撤销或者终止的，不影响合同中有关解决争议方法的条款的效力。