行政公益诉讼的被告是行政机关吗

是。
1、公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，作出具体行政行为的行政机关是被告;
2、经复议的案件，复议机关决定维持原具体行政行为，作出原具体行政行为的行政机关是被告;复议机关改变原具体行政行为的，复议机关是被告;
3、两个以上行政机关作出同一具体行政行为的，共同作出具体行政行为的行政机关是共同被告;
4、由法律、法规授权的组织所作的具体行政行为，该组织是被告。由行政机关委托的组织;
5、所作的具体行政行为，委托的行政机关是被告;
6、行政机关被撤销的，继续行使职权的行政机关是被告。
《行政诉讼法》第二十六条