退股协议只有公司公章有效吗

无效。股东入股后，不能退股。股东无论是用实物、货币、知识产权或是其他法律允许的方式出资，都是所有权的转移，而不是简单的给公司使用。如果协议的标题叫退股协议书，里面约定的都是股权转让给另外一个股东，这种协议应当算股权转让协议，应视为有效。

《中华人民共和国公司法》

第七十四条

有下列情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权：（一）公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；（二）公司合并、分立、转让主要财产的；（三）公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。自股东会会议决议通过之日起六十日内，股东与公司不能达成股权收购协议的，股东可以自股东会会议决议通过之日起九十日内向人民法院提起诉讼。