股权投资协议可以代签吗

可以。须有授权委托程序与法律文书作支持，这样可以确认为代签人手印的有效性与代理行为的有效性。否则，合同构建时就存在了瑕庇，效力受限了(即乙方认可有效，不认可无效了)。
《民法典》第一百六十二条 代理人在代理权限内，以被代理人名义实施的民事法律行为，对被代理人发生效力。