疫情期间擅自封村封路不让回家合法么

不合法。对未经批准擅自设卡拦截、断路阻断交通等违法行为，是不被法律允许的。
根据我国《刑法》中第117条中相关规定，破坏轨道、桥梁、隧道、公路、机场、航道、灯塔、标志或者进行其他破坏活动，使得火车、汽车、船只、航空器等交通工具有被倾覆或被毁坏的危险，但尚未造成严重后果的，依法可判处3年以上10年以下有期徒刑。