机动车肇事撞死人,三者100万,保险公司该如何理赔

撞死人后保险公司赔。只要不存在免责情形的，撞死人后保险公司就应当赔偿。法律规定机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照规定承担赔偿责任。
【法律依据】
《机动车交通事故责任强制保险条例》第21条，被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。道路交通事故的损失是由受害人故意造成的，保险公司不予赔偿。