单位旷工扣了500工资合理不

不合法的，按法规的要求，员工旷工只是当天不给工资，如果旷工一天扣500元，属于克扣工资行为，可以申请仲裁的。
【法律依据】
《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。