可以协议离婚,孩子抚养权由法院判吗

可以。法院在判决协议离婚财产划分的时候，孩子的抚养权也是属于夫妻之前的共同财产，划分财产的同时也会判决孩子的抚养权，但是如果有特殊情况，法院会在判决协议离婚之后重新对孩子抚养权问题进行审理，如果是对法院判决的抚养权归属不满意的，也可以在审判结束后重新提交诉讼申请。
【法律依据】《民法典》第一千零七十六条　夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。