合同章不备案违法吗

依据相关法律的规定，企业的印章是需要备案的，如果不备案是不能启用的，所以公章不备案启用是违法的行为。
《民办非企业单位印章管理规定》三、印章的刻制审批程序
民办非企业单位刻制印章须在取得登记证书后向登记管理机关提出书面申请及印章式样，经批准后持登记管理机关开具的同意刻制印章介绍信及登记证书到所在地县、市(区)以上公安机关办理准刻手续后，方可刻制。

法律依据：
《民办非企业单位印章管理规定》
三、印章的刻制审批程序
民办非企业单位刻制印章须在取得登记证书后向登记管理机关提出书面申请及印章式样，经批准后持登记管理机关开具的同意刻制印章介绍信及登记证书到所在地县、市(区)以上公安机关办理准刻手续后，方可刻制。