专用发票丢失会罚款吗

一般不会罚款，但超过90天就不能抵扣进项税额了，可价税合计记入库存商品成本。
增值税是以商品(含应税劳务)在流转过程中产生的增值额作为计税依据而征收的一种流转税。从计税原理上说，增值税是对商品生产、流通、劳务服务中多个环节的新增价值或商品的附加值征收的一种流转税。实行价外税，也就是由消费者负担，有增值才征税没增值不征税。
《增值税专用发票使用规定》第二十八条