承包工程合同纠纷由哪个部门解决

这属于民事纠纷，可以双方协商解决，协商不成的，如果有仲裁条款，可以向约定的仲裁委提起仲裁，没有约定的，可以去有管辖权的法院诉讼解决。
建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。
建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。建设工程合同应当采用书面形式。

法律依据

《民法典》第二百三十三条
物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。